Câu lạc bộ được thành lập vào năm 1949 với tên gọi Flight Refueling F.C. và chơi trong các giải đấu Dorset địa phương.[2] Câu lạc bộ đã cố gắng vươn lên trong các giải đấu và tham gia Dorset Combination league vào đầu mùa giải 1958-59.[3] Tuy nhiên, đội chỉ trụ được 2 mùa giải ở giải và phải đợi đến mùa giải 1977-78.[3] Mùa giải đầu tiên trở lại giải đấu Dorset Combination đã thành công rực rỡ khi đội kết thúc mùa giải với tư cách Vô địch.[2] Bốn mùa giải sau đó trong mùa dịch 1980-81, câu lạc bộ có trận ra mắt trong FA Vase và tiếp tục thi đấu cho đến cuối mùa giải 1994-95 khi các quy định về mặt sân mới ngăn đội bóng tham gia thi đấu.[2][3] Họ đổi tên thành Cobham Sports F.C. vào năm 2001.[4]

Vào đầu mùa giải 2010-11, câu lạc bộ hợp nhất với Merley Allendale Youth FC, và đổi tên thành Merley Cobham Sports F.C.[5][6] Vào tháng 5 năm 2012, câu lạc bộ đã được trao chứng nhận Tiêu chuẩn điều lệ FA.[7]